却说姜维看到魏延踏灭了主灯，心中非常愤怒，拔剑想要杀他。但孔明制止了他说：“这是我的命数将尽，不是文长的过错。”姜维于是收起了剑。孔明吐了几口血，躺在床上，对魏延说：“这是司马懿预料到我有病，所以派人来探视虚实。你可以紧急出兵迎战。”魏延领命，出帐上马，带兵杀出寨来。夏侯霸看到魏延，慌忙带领jūn_duì 撤退，魏延追赶了二十多里才回来。孔明命令魏延回本寨把守。
姜维进入帐篷，直接到孔明的床前问候。孔明说：“我本来想竭尽全力，恢复中原，重振汉室，但天意如此，我将不久于人世。我一生所学，已经写成二十四篇书，共计十万四千一百一十二字，其中包括八务、七戒、六恐、五惧的法则。我遍观诸将，没有人可以传授，只有你可以继承我的书。千万不要轻视它！”姜维哭着接受了。孔明又说：“我有‘连弩’的方法，一直没有使用过。这种方法矢长八寸，一弩可以发射十矢，都已经画成图本。你可以依法制造使用。”姜维也接受了。孔明又说：“蜀中的各条道路，都不必太过担忧，只有阴平这个地方，需要特别小心。虽然这里地势险峻，但时间久了必然会有失守的风险。”孔明又召唤马岱进入帐篷，低声耳语，传授给他密计，并嘱咐说：“我死之后，你可以按照计划行事。”马岱领了计策就出去了。
过了一会儿，杨仪进来，孔明把他叫到床前，交给他一个锦囊，并密密地嘱咐说：“我死后，魏延必然会反叛。当他反叛的时候，你与他临阵对敌，再打开这个锦囊。那时自然会有斩杀魏延的人。”孔明一一安排完毕，便昏迷过去，到晚上才苏醒过来，就连夜上表奏报后主。
后主听到奏报非常吃惊，急忙命令尚书李福星夜赶到军中问候孔明，并询问后事。李福领命，加速赶往五丈原，见到孔明后传达了后主的命令。问候完毕后，孔明流泪说：“我不幸中途丧命，虚度了国家大事，对天下人有罪。我死后你们应该竭尽忠诚辅佐主上。国家的旧制度不可更改我任用的人也不可轻易废除。我的兵法都传授给了姜维他自然能继承我的遗志为国家出力。我的生命已经在旦夕之间了应当立即写下遗表奏报天子。”李福领了孔明的话匆匆辞去。
孔明勉强支撑起病体让左右的人扶上小车出寨遍观各营自觉秋风吹面彻骨生寒于是长叹道：“再也不能临阵讨贼了啊！悠悠苍天为什么这样无情啊！”叹息了很久才回到帐中病情更加沉重了就叫来杨仪吩咐说：“王平、廖化、张嶷、张翼、吴懿等人都是忠义之士久经战阵多次建立功勋可以委以重任。我死之后凡事都要按照旧法执行缓缓退兵不可急躁。你深通谋略不必我多说。姜伯约智勇双全可以负责断后。”杨仪哭着接受了命令。
孔明让人取来文房四宝在卧榻上亲手写下遗表来达于后主。表中写道：我听说生死有常数难以逃避。现在死亡即将来临我愿意尽我最后的忠诚：我本性愚拙却遭遇了这艰难的时世身为丞相专掌国家大权兴师北伐却未能成功。没想到我病入膏肓生命垂危无法完成辅佐陛下的大业真是遗恨无穷啊！我希望陛下能够清心寡欲克制自己爱护百姓；对先皇尽孝道对天下施仁政；提拔那些隐居的人才让他们有机会为国家出力；排斥那些邪恶之徒以淳厚社会风气。我家在成都有八百棵桑树十五顷薄田子弟们的衣食自给自足还有富余。至于我在外面做官并没有别的经营和调度随身衣食都仰赖公家没有别的生计可以增加家财。我死的时候不会让家里有多余的钱财外面有剩余的财物这会有负于陛下啊。
孔明写完遗表后又嘱咐杨仪说：“我死之后不可发丧。可以做一个大龛将我的尸体放在龛中嘴里放上七粒米脚下点上一盏明灯。军中要保持安静如常不要举哀这样将星就不会坠落。我的阴魂自会起来镇守这里。司马懿看到将星不坠落必然会惊疑不定。我军可以让后寨先行然后一营一营缓缓而退。”
孔明对杨仪说：“如果司马懿来追，你可以布下阵势，然后掉转旗帜，擂鼓回击。等他来到，就把我先前雕刻的木像放在车上，推到军前，让大小将士分列左右。司马懿看到后必然会惊慌逃走。”杨仪一一应诺。当夜，孔明让人扶他出来，他仰观北斗，指着其中一颗星说：“这就是我的将星。”众人看去，只见那颗星色昏暗，摇摇欲坠。孔明用剑指着它，口中念咒。咒完急回帐中，此时他已不省人事。众将正慌乱间，尚书李福又来了。他见孔明已昏厥，口不能言，于是大哭道：“我耽误了国家大事啊！”过了一会儿，孔明又苏醒过来，开眼看到李福站在榻前。孔明说：“我已经知道你又来的意思。”李福道歉说：“我奉天子之命，来问丞相您去世后，谁可以接任大事。刚才因为匆忙，忘了请教，所以又来了。”孔明说：“我死后，蒋公琰可以接任大事。”李福又问：“蒋公琰之后，谁可以接任？”孔明说：“费文伟可以接任。”李福再问：“费文伟之后，谁应当接任？”孔明不再回答。众将上前看去，他已经去世了。这时是建兴十二年秋八月二十三日，他享年五十四岁。后来杜甫有诗感叹说：“长星昨夜坠落前营，报告说孔明今日已逝。虎帐中再也听不到他的号令声，只有他的功勋名声永存。他空留下门下三千客，辜负了胸中的十万兵。如今在这绿荫清昼里，再也听不到他那悠扬的雅歌声！”白居易也有诗写道：“孔明先生隐居山林不露踪迹，直到刘备三顾茅庐才遇到明主。他像鱼儿得到水一样得到施展才华的机会，像龙飞上天空就能降下甘霖。刘备托孤时他尽心尽力地辅佐新主，报效国家时他倾注了全部的忠诚和义气。他前后出师表所表现出的忠诚和才智令人一读之下就泪流满面。”
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当初蜀国的长水校尉廖立自认为才名和孔明相当应该做孔明的副手，但因为职位闲散而心怀不满经常抱怨诽谤他人。于是孔明将他废为平民流放到汶山。当他听说孔明去世的消息时他垂泪叹息道：“我最终还是要沦为异族统治下的百姓了！”李严听到这个消息也大哭而死。大概是因为他曾希望孔明能再次重用自己以便有机会弥补过去的过错但他估计孔明死后没有人会再用他了。后来元稹有诗赞美孔明说：“他拨乱反正辅佐危主尽心尽力地接受了托孤的重任。他的英才超过了管仲和乐毅他的妙计胜过了孙武和吴起。他威严的《出师表》和他巧妙的八阵图都表现出他的高尚品德和卓越才智。像孔明这样完美的人才是古今无双的！”