直到2002年韩日世界杯葡萄牙人才再次入围世界杯，不过此时黄金一代只剩下了鲁伊·科斯塔和菲戈两人，他们在出线关键战中零比一输给了韩国队，再次止步小组赛。
2006年德国世界杯，新一代球员的崛起帮助葡萄牙队实现了突破，他们在淘汰中接连击败荷兰和英格兰，时隔四十年之后再次打进世界杯四强，半决赛葡萄牙队零比一不敌法国，随后的三四名决赛中，无心恋战的葡萄牙队一比三输给了东道主德国队，最终名列第四。
葡萄牙队在预选赛上的表现让人不敢恭维，开赛之初连续四轮不胜让他们看起来即将与世界杯无缘，好在随后的几场关键战葡萄牙队都取得胜利，再加上竞争对手瑞典队后期表现糟糕，葡萄牙队才惊险从小组中突围。
葡萄牙队的阵容缺少中锋是老问题了，保莱塔退役之后该队在这个位置上更加薄弱，预选赛中为葡萄牙队攻城拔寨的主要是边锋，西芒和纳尼分别打进四球和三球，位列球队射手榜的前两位。三十二岁的中锋利德松在预选赛后半阶段打上主力，六场比赛打进两球，他的发挥将直接影响葡萄牙队在世界杯上成绩。
作为当时世界上身价最高的球员，克里斯蒂亚诺·罗纳尔多却始终在国家队中找不到感觉，预选赛中c罗出场七次一球未进，作用远不及他在曼联和皇马突出。世界杯大赛对他来说既是机会更是考验，他需要用自己的表现带给葡萄牙胜利，为自己的世界第一身价正名。
葡萄牙队预选赛十四场比赛只失五球，由皇马后卫佩佩和皇马主力卡瓦略领衔的后防线足以令人放心。世界杯这样的大赛，防守是取得好成绩的基础，由此看来，葡萄牙队在南非世界杯的表现还是非常值得期待的。
2010年南非世界杯，由c罗带领葡萄牙战舰扬帆起航。小组赛首场对战号称非洲大象的“科特迪瓦“首站双方战成平手。次战葡萄牙战舰火力全开七比零狂胜神秘之师“朝鲜队“，末战对战有历史渊源的桑巴军团，最终互交白卷，葡萄牙小组赛以零失球出线晋级。在对阵西班牙的最后阶段由比利亚打进一粒有越位嫌疑的进球，最终葡萄牙饮恨十六强。