1981年西汉姆联重返英甲，随后的四年时间，西汉姆联稳居英甲积分榜前十，而1985-86赛季，他们创造了俱乐部历史上的联赛最佳战绩联赛第三名，但不幸的是1989年西汉姆联再度降级，莱尔也结束了自己在西汉姆联漫长的执教生涯。
接替莱尔的是卢·麦卡里，由于在执教斯温顿镇期间涉嫌非法赌博，为洗清罪名，执教不到一年时间的马卡里选择了辞职，前球员比利·邦兹正式就任球队的主教练。1990-91赛季邦兹首次西汉姆联足球俱乐部带队就帮助球队杀回了英甲联赛，不过次年他们又再度降回英乙。同年由于英超的诞生，英格兰职业足球联赛体系进行全面调整，英乙联赛也更名为英甲联赛，1992-93赛季西汉姆联获得英甲联赛亚军，杀回了次年的英超。
1994年8月哈里·雷德克纳普取代了邦兹的帅位，1998-99赛季他率队获得英超第五，距离欧洲联盟杯资格仅一步之遥，最终凭借拿下国际托托杯冠军，西汉姆联晋级欧洲联盟杯正赛，尽管带队期间球队成绩稳定，但由于与俱乐部管理层意见不一，2000-01赛季开始前雷德克纳普宣布辞职，接替他的是年轻的格伦·罗德尔，后者刚刚从青年队教练的位置上上调。
罗德尔上任首个赛季，西汉姆联取得英超第七，但球队却在接下来的联赛中遭遇一系列惨败，比如一比七负于布莱克本、零比五不敌埃弗顿、一比五负于切尔西，随后的一个赛季西汉姆联开局不佳，并最终不幸降级。英超采用三十八轮赛制以来，西汉姆联的四十二个英超积分是所有降级球队中最高的，罗德尔在赛季由于需要接受脑部肿瘤的治疗而缺席了部分比赛。
2003年8月24日罗德尔与俱乐部解除了合同，此时英冠联赛已经进行到了第三轮。之前在罗德尔缺席期间代理主教练职务的特雷沃·布鲁金临时接管球队，不过2003年10月阿兰·帕杜成为球队的新任主教练，西汉姆联一度逼近联赛领头羊雷丁足球俱乐部，但还是不得不参加升级附加赛，最终他们被水晶宫足球俱乐部击败，不得不留在了英冠，次年再度杀入升级附加赛决赛的他们一比零战胜普雷斯顿足球俱乐部，终于得以重返英超。
重返英超的首个赛季，西汉姆联就收获第九名的佳绩，2005-06赛季，西汉姆联达到了球队新的顶峰，他们杀入了当年的英格兰足总杯决赛，但最终却惜败给利物浦，尽管仅仅获得亚军，但由于利物浦已经获得欧洲冠军联赛的资格，因而西汉姆联得以参加次年的欧洲联盟杯。
2006年8月西汉姆联完成了当时曾轰动一时的转会。俱乐部签下了当时风头正劲、已经引起多家欧洲豪门觊觎的卡洛斯·特维斯和贾维尔·马斯切拉诺，2006年11月埃格特·马格努松领导的一家冰岛财团收购了俱乐部，帕杜随即因球队战绩不佳而被解职，取代他的是前查尔顿竞技主教练阿兰·科比什利。
特维斯和马斯切拉诺的转会随即遭到了英足总的调查，这桩转会被指并没有支付相应的转会费，2007年4月西汉姆联被判处缴纳五百五十万英镑的罚款，但逃过了被扣除积分的处罚，这也引发了当时的巨大争议，一旦扣除积分，西汉姆联就极有可能降入英冠，维甘竞技主席戴夫·惠兰联络了当时面临降级危险的富勒姆和谢菲尔德联的负责人威胁将动用司法手段。