向宠派人来报已经控制多驿府；
坐镇奉天门的蒋万里派人来报，步军右营已控制六部衙门、理藩院衙门、弘文馆。
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随着明军大举入城，内城之中的八旗宗室知道大势已去，除努尔哈赤九子巴布泰试图带领府上的旗丁奴才和明军拼死一战，结果被乱箭射死后，其余的宗室都接受了失败的命运。他们乖乖的呆在府上，没有任何反抗举动，任由明军将他们的府邸包围，其中包括随奴尔哈赤征战一生的老都堂阿墩。
内城中除了已死的代善和巴布泰外，还有三个奴尔哈赤的儿子，这三个不被洪太看重的兄弟分别是老奴十一子——镶黄旗梅勒额真巴布海、十三子——正白旗牛录章京赖幕布、十六子——正黄旗牛录章京费扬果。
这兄弟三人平素就与洪太不和，对五哥莽古尔泰抱以同情，故而明军入城后，他们没有选择以死抵抗，反而打开府门命令家奴向明军投降。期间还试图派人联络莽古尔泰，却遭到明军的拒绝。
在明军的满城大搜捕中，中了流矢的额驸扬古利在家中被搜出，随后被斩杀割首。
叫明军铳子打瞎了眼睛的杜度尸体在城头被发现，随后也被割取首级。
胳膊被砍断了一半的索尼因为失血过多，倒毙在离家门不到五十米的地方；
代善的亲信将领塔赖身中十几箭生死不知；
重伤昏迷的孙得功被几个投降的汉军绑了献给明军；
祖泽润、祖泽远、祖泽传三兄弟在叔父祖大成的带领下跪伏向明军投降，韩大勋则在乱军中被杀。
祖可法念在祖大寿情份上暂时受了祖泽润他们的投降，但也不敢擅藏，而是命令部下将他们押到奉天门由锦州军大将蒋万里处置。
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城破之后攻进城中的明军太杂，有莽古尔泰的辽阳旗兵和镶蓝旗汉民，也有张存仁等归降汉将率领的汉军，而锦州军只步军左营加上亲兵营，人数只5500人，这5500人还要留一个千户协同守卫外城，安抚外城汉民，故而内城的锦州兵不到4000人。
城外的两个炮兵千户派不上用场，所以大胜之后的锦州军面临严重的人手不足问题，导致虽然控制了内城，但真正控制在锦州军手中的地方并不是太多。
内城之中大小贝勒府十几处，宗室、大臣、八旗将领的府邸不下百家，再加上汗王宫、福晋衙门、六部衙门等需要分兵占领的地方实在是太多。锦州军不可能将有限的兵力分散开挨个攻占这些地方，因此只能交出一些地方让辽阳旗兵和投降的汉军来控制，这中间混水摸鱼的事情自然是无法避免的。
确认内城的要害地方全部被占领后，大勇派亲兵秘密召集蒋万里、郭城、李固、向宠、郑泰、尚可喜等将领至汗王宫密商。
密商之后，锦州诸将便各自分头行事，很快，额必伦和张定辽等人便接到施大勇军令，命令他们将所围府中的旗人宗室一律押到位于理藩院待命。
又传令各军将城中八旗妇孺分男丁、女丁押解，男丁一律解往小东关镶红旗驻地，女丁一律解往汗王宫。
又令城外的炮兵千户董忠立即带队赶往位于沈阳东郊的努尔哈赤墓——福陵。
命令得到了有效执行，一切都在按步就班的进行着。
夜深之后，放松下来的大勇想到了衍庆宫的叶赫。