对于普遍还是处于游牧状态的北方蒙古部落来说，科尔沁诸部蒙古人相对比较开化一点，已经领先一步进入了定居驻牧的阶段。
这也是为什么他们较早地背叛林丹汗，选择投靠女真人的原因。
虽然他们与察哈尔蒙古人一样，都是蒙古人，但是他们定居在东北女真部落的边缘，更与后来统一了女真各部的后金国接壤。
林丹汗与女真人作战失败之后，可以西迁，可以带着察哈尔的人马继续往西游牧，反正整个蒙古大草原，对于林丹汗及其麾下的察哈尔传统蒙古人来说，没有地方是不可以去的，而且到哪里游牧，也没有什么太大的区别。
但是已经习惯了定居驻牧的科尔沁蒙古人不同，他们有了城池，习惯了定居生活，不想到处迁徙，再过传统的那种逐水草二居的游牧生活。
因此，早在大明天启六年，也就是后金国的天命十一年，林丹汗率部西迁之后，一直左右摇摆的奥巴，也当机立断地率领居住在格勒珠尔根山城一带的科尔沁本部众台吉，正式投靠了奴儿哈赤。
奴儿哈赤曾经率部攻打过格勒珠尔根山城，但是每次除了采取围困之外，都没有别的办法攻下。
因此，当奥巴率部归降之后，奴儿哈赤非常高兴，不仅将一个孙女赐给了奥巴为妻，当奥巴当上了野猪皮家族的和硕额附，而且还异乎寻常地破例赐给了奥巴一个土谢图汗的封号。
不过即便是如此，在原本的历史上，当黄台吉西征察哈尔林丹汗的时候，奥巴汗也没有接受黄台吉的征调命令。
然而这一次，或许是迫于黄台吉当时北征野人女真、北山女真大胜归来的威势，奥巴汗阴差阳错地同意了黄台吉征调其部从征的命令，而且还亲自率部前往，结果一去不回，命丧紫荆关下。
这回，黄台吉在东归途中，特意来到格勒珠尔根山城停留，就是为了安抚科尔沁本部人马。
黄台吉带领着左右女真权贵，在格勒珠尔根停留了十天，先是在科尔沁人为奥巴汗准备的衣冠冢前，率众隆重地祭奠了奥巴汗的在天之灵，然后封奥巴之子巴达礼台吉为和硕贝勒，继承了奥巴之位。
随后，黄台吉借着这个机会，又召集了包括阿鲁科尔沁在内的科尔沁诸部贝勒台吉们，以及不离不弃一直跟随的几个蒙古部落首领，齐聚格勒珠尔根山城，再次搞了个会盟。
在这次格勒珠尔根会盟之中，黄台吉依照女真八旗制度，将科尔沁四部改为科尔沁左右前后四旗：以斋桑所部原科尔沁左翼部落为科尔沁左旗，以孔果尔所部原科尔沁右翼部落为科尔沁右旗，以阿鲁科尔沁所部为科尔沁前旗，以巴达礼所部科尔沁为科尔沁后旗。
并且分别以斋桑、孔果尔、达赖褚虎尔、巴达礼四人为旗主，赐四人均为和硕贝勒。
科尔沁前后左右四旗旗下均按女真八旗制度，改编为牛录、甲喇，三百户为一牛录，五牛录为一甲喇，五甲喇为一固山。
虽然这一次大败而归之后，斋桑、孔果尔、巴达礼等人麾下的科尔沁部众，已经凑不够一个固山七千五百户的壮丁了，但是这个时候，不管是黄台吉本人，还是这几个新晋的和硕贝勒蒙古旗主，也都没人去计较这个事情了。
与此同时，一直鞍前马后跟着西征和南下的扎鲁特、扎赉特和东西乌珠穆沁四部也被升格为四旗，扎鲁特部成为扎鲁特旗，扎赉特部成为扎赉特旗，东乌珠穆沁为乌珠穆沁左旗，西乌珠穆沁为乌珠穆沁右旗，四部首领从台吉直接被黄台吉封为旗主贝勒。
这四旗，原本比科尔沁诸部弱小，归附了女真人之后，在后金国的地位也比较地下，这一次，在黄台吉的封赏之下，地位扶摇直上，除了不是大贝勒，也就是和硕贝勒之外，其他的一切都与科尔沁四旗一样了。
然而，这些新立的蒙古旗，要想获得与女真八旗的地位，那当然是痴心妄想。
说到底，他们也不过是女真八旗的附庸和炮灰，因为黄台吉在设立这八个蒙古旗之后，不仅把这八个蒙古旗纳入了后金国的管理之下，而且顺手还将科尔沁四旗归由正黄旗节制调度。
同时，黄台吉也下令，将失去了驻牧之地的扎鲁特旗、扎赉特旗，以及乌珠穆沁左右两旗，迁往松花江上游两岸原海西女真四部旧地即后世吉林东部地区安置居住，并让此四旗归入镶黄旗麾下节制调遣。