六科廊以小制大的权力和太监们的权力一样，都是皇帝给的。
与此同时，也都是一把双刃剑。
朱元璋当初制定这样的制度，目的是为了反制宰相或者朝中权臣的权力。
后来胡惟庸案之后，朱元璋撤销了左右丞相的设置，让六部直接向自己奏事，直接听命于自己，但在同时，他却没有撤销六科廊。
他的初心是好的，担心将来自己的子孙后代之中，一旦出现了暗弱之主，那么朝堂之上有了六科廊言官的制约，皇帝就不至于被六部尚书或者朝中显贵大臣所欺瞒或者架空。
因为六科分别对应朝廷的六部。
六部所有公文或者草拟的旨意，都要经过六科的审核，审核不能通过者，六科可以封驳，使之无法生效。
朱元璋的初心当然是好的，但是六科廊这种位卑而权大的设置，到了明末却成为了党争的工具。
六科廊言官们不问是非只看门户的弹劾与封驳，让朝堂政务陷入一次又一次停滞和混乱。
不仅降低了朝廷决策的效率，而且搞乱了是非尊卑。
对于崇祯皇帝主动限制六科廊的权力，还以君权天授的忠君大义拿走了六科廊的封驳之权，内阁诸臣和六部堂官们则是乐见其成。
除了六科廊的言官们以祖宗法度为由上书力争之外，没有有分量的大臣站出来说话。
因为对于朝中有分量的大臣们来说，六科廊言官的权力过大，对他们任何一个人来说，都是一个制约或者威胁。
尤其是内阁辅臣和六部尚书，人人都觉得身上顿时少了一道枷锁。
而对于如今的崇祯皇帝而言，他是不得已而为此。
因为，这一把利剑既然不能在短时间内完全控制在自己的手中，那么就只好将它放到剑鞘里了。
正因为这样，这一次纵然是朝议纷纷，但是崇祯皇帝还是快刀斩乱麻地，很快就通过了对平定奢安之乱有功之人的封赏诏书，只对其中一些不是完全符合自己心意的问题，略微做出了一些调整。
对御史言官们关注的朱燮元驭将不严，甚至公然放纵麾下各部烧杀抢掠的问题，只以一句话发给六科廊和都察院的一句上谕答之。
崇祯皇帝在指明了传给都察院和六科廊官员的上谕中说道：“朝廷平定西南，事体亦大，然朝官身临前线任事而专责者，不过朱燮元以下数人耳！朕未见此时上书争议功赏之人曾出一分力！以无功而评有功，已属本末颠倒，而以无功妒有功，更是其心可诛！”
皇帝的态度已经很明确了，而朝中重臣没有什么人站出来反对，也让一些人首鼠两端。
因此，收到了这个上谕之后，都察院和六科廊的御史言官们，顿时消停了不少，原本还想接着上书刷存在的，也都偃旗息鼓了。
崇祯二年八月十二日，就在西南平定的消息传开十天之后，大明朝廷封赏西南有功将士的诏书，正式昭告天下。
而曾经参与过平定西南奢安之乱战事的讲武堂总监傅宗龙，则被崇祯皇帝亲自点名，成为了这一次朝廷传旨封赏西南将帅的钦使，带着大队的锦衣卫人员和一封封封爵升官的圣旨，以及被皇帝亲自点名前往西南任职的一批官员，离京南下，一路辗转前往西南去了。
根据皇帝最后的旨意，朱燮元在功封靖南侯的同时，交卸了南京兵部尚书的兼职，同时也失去了兼领四川、湖广、广西军务的权力，从此专任云贵总督，而且不再驻留贵阳兼任贵州巡抚，而是要在旨到之日，带着自己的督标罗乾象所部，将云贵总督的行辕从贵阳移驻到昆明去。