伴随着王廷臣等人任职京营的命令一起下达的，还有蓟镇总兵官的正式任命。
崇祯皇帝轻车简从到居庸关视察防务，并在居庸关城内处死守关将领王承胤以及蓟镇大帅刘策的消息，直到现在，才以朝廷诏令的形式正式公开，而同时公开的还有关于任命建昌营总兵尤世威担任蓟镇总兵官的命令。
这一消息当然更令朝臣大哗，一个接一个的文臣上书，批评皇帝这事做得太鲁莽太草率。
然而这些奏疏进了通政司之后，就如同石沉大海了一般，根本没有一点回音。
如今的这位崇祯皇帝，可是知道明末时期这些文官的脾气秉性的，因此对所有借机乱发议论以邀名的奏章，全部留中不发，不与答复，也不作处理。
因为他知道，跟这些以上书言事为职业的清流言官，一旦认真较劲起来，那么你就输了。
对付这些人，就得学学万历皇帝的办法，那就是见怪不怪，其怪自败。
崇祯皇帝与清洗了蓟镇刘策势力之后回来的孙承宗，以及其他两个军机大臣，一番商议之后，很快就下定决心任命尤世威为蓟镇总兵官，并继续兼领建昌营。
与此同时，蓟镇总兵府移驻遵化，命令尤世威就近整顿蓟镇沿边各处关口卫所，对照兵籍核实兵员，并参照辽东棱堡筑城之法，重修沿边各口以及遵化城。
历史上，崇祯二年冬黄台吉率领建虏大军，就是从遵化北面的喜峰口、大安口等地攻入京畿之地的。
重新任命了蓟镇总兵官后，崇祯皇帝下旨申斥了蓟镇监军御史施邦曜，斥其未能恪尽监军御史之职责，致使居庸关沿线军备废弛，卫所人地皆失。
施邦曜也是连忙上疏，自请处分。
事实上，不是他不想恪尽职守，实在是他原本只是一个工部营缮清吏司的一个员外郎，骤然之间被赋予蓟镇监军御史的重担，与久镇边关的蓟镇总兵官、挂征北将军印的大帅刘策平起平坐，心里先就没了底气。
若是刘策配合还好，若是其不配合，施邦曜这样一个在蓟镇边军之中毫无根基的外来人，如何能够推动整个蓟镇按照自己的意愿整改呢。
凡是有皇帝明确旨意的，比如说自建监军标营，以及建昌营、三屯营前出塞外，名存实亡的昌平营裁减撤并，施邦曜都拿着尚方宝剑坚决推动落实了，但是沿边卫所清查整治这种事关蓟镇上下将官阶层直接利益的事情，却始终进展缓慢。
如今皇帝下旨申斥，心中虽然不平，但也没有办法喊冤，毕竟这是皇帝当初赋予他的责任，而居庸关的情况他也并非一无所知，但却无所作为。
蓟镇的事情安排好了之后，时间已经进入了崇祯元年十一月的中旬。
十一月十二日，崇祯皇帝先是在文华殿中，召见了内阁阁臣，将熹宗皇帝大葬的各项繁琐复杂的后续事宜，全部委托给内阁首辅李国鐠和阁臣兼礼部尚书徐光启代行，然后移驾武英殿，与三位军机大臣议事。
到了武英殿中，君臣落座，舍人侍立。崇祯皇帝斟酌着说道：“近日以来，朝廷上下对于朕整治勋贵及京营、卫所议论纷纷。一些言官御史也上书弹劾诸位，想必卿等也有耳闻。”
说完这话，崇祯皇帝略作停顿，看了看手下的这几位面色沉重的忠臣，然后接着说道：“对于这些议论弹劾，卿等不必在意，权当狂犬吠日就好。
“京营一日不堪用，京师就一日难万全。因此，整顿京营，是朕登极以来就一直想做的事情。
“如今在诸位爱卿帮助之下，总算是迈出了第一步。虽然是第一步，却是难得的一大步。
“卿等已历事三朝，对朕父兄作为比朕更为了解。先帝也曾决心整顿京营，然而却一再半途而废？何以如此？
“朕以为，朕的皇父皇兄只看到了京营的废弛，却没有看到京营废弛的症结所在。不清除掉依附在京营身上的蛀虫吸血鬼，整顿京营就是一句空话，不清除掉贪赃枉法、胆大妄为的勋贵武臣，清查整治京畿卫所也是一句空话。这就是朕为什么要如此这般作为的原因。
“可惜朝廷上下多有颟顸愚昧者见不及此，以为朕整治京师勋贵武臣，是为图其家财，或是因言治罪，一个个理直气壮地上书骂朕贪暴嗜杀。
“卿等久在朕的身边，对朕有所了解，想来也不必朕再作解释了。”