这时，唐军已经推进到长安近郊，为了给黄巢添堵，李克用采取了类似于今天恐怖主义的作战方式，命康君立、薛志勤两将组织精锐的特种小分队，利用夜晚潜进长安城展开不间断的骚扰性袭击。于是，城中齐军的粮库、军械库时时失火，落单的齐朝官员和士兵频频遭暗杀，全城人心惶惶，不可终日。
三月二十七日，在唐军围城一个月之后，孤立无援的华州被攻克，黄巢的两个弟弟弃城逃走（另一说黄邺被唐军生擒），齐帝国第三次缩小成了长安城邦，而且面临处境远比上两次更加绝望。
四月初，感到大反攻时机已经成熟的唐军京东行营统帅部（此时的事实统帅应是已是杨复光）下令，对长安发起了全面进攻。自然，在这次进攻中打头阵的jūn_duì 还是李克用和他横扫天下的沙陀军，部份忠武军与河中军也参与进来，配合李克用作战，义成（此时的节度使即前总司令王铎）军和义武（节度使王处存，是李克用的亲家）军随后跟进，连原先那些出工不出力的藩镇，见形势大好，也不愿错过打落水狗和发战争财的良机，纷纷发兵参战。
面对内外交困、强敌压境的恶劣局面，黄巢仍不愿意退出长安，退出这座事实上已经无法防守的危城。为了保住齐朝最后一丝“正统”的象征，黄巢在长安近郊构筑了数条防线，督促齐军拼死抵抗，战况极为激烈。仅在一天之内，唐、齐两军就发生了三次会战，齐军三战三败，城外防线瓦解。
四月五日（也可能是八日或十日，各史书记载不一致），唐军各部集中了一百个都的庞大兵力（按正常编制应为十万人，考虑到太平时军官们倾向于不满编，好吃空饷，战乱时军阀们倾向于超编，以用于争霸，所以唐军参战人数可能超过十万）发动了总攻！
因为后世有被宣传得十分著名的“百团大战”，依同一标准，这里也可以将唐军第二次收复长安的这一系列交战，称作为“百都大战”。
攻城开始，毫无疑问，仍是李克用一如既往地冲锋在前，犹如一柄尖刀，率先突破光泰门（长安禁苑东面北起第二门），攻入了大明宫旁边的皇家禁苑！禁苑，位于长安城之北，范围广大，“东距浐，北枕渭，西包汉长安城，南接都城，东西二十七里，南北二十三里，周一百二十里”，不过其精确范围，今天尚不能确定，还有待考古学家们的研究，但是可以肯定的是：如果伪帝黄巢的耳力没有问题的话，他应该已经能够听见东边沙陀军疯狂的喊杀声了！来李克用攻城，也是利用了唐大明宫突出于主城外的特点，试图来一次后世美军最爱的斩首行动。
飞矢流箭越过高墙，已经安居深宫近两年，许久未曾上过前线的齐帝黄巢知道危险已迫在眉睫，终于也急红了眼，亲自撸起袖子，指挥齐军布阵于皇家宫阙的琼楼玉宇间，利用每一间殿堂、每一条御道的有利地形，与突入的李克用军展开激烈巷战。但此时的长安，不是两年多前的潼关，他的“御驾亲征”也无法挽回败局了！
这一战从卯时（上午5：00至7：00）激战到申时（下午5：00至7：00），依旧是李克用军的先头军，首先占领望春-宫升阳殿（位于大明宫正东），齐军在禁苑的防御再次溃败。虽然仍是心有不甘，但黄巢也只能重重地叹了口气：长安，我的帝都，终于还是要和你说再见了！
随后，黄巢下令放火焚烧大明宫和周边禁苑，全军撤出长安，向蓝田方向突围。从广明元年十二月初到现在，黄巢占据长安共计两年零四个月。
从两军主要交战情况来，黄巢在皇宫纵火的主要目的，应该还是利用大火阻挡追兵。当然也不排除这个丧心病狂之徒有着“我得不到的东西，也不留给别人”的恶劣想法。但黄巢虽然是个几乎没有人性的杀人狂魔，但这里还是要公道的说一句：此时可能性不是太大，因为位于长安主城墙内的太极宫、兴庆宫等未受波及，从黄巢逃亡方向推断，他应该要路过兴庆宫。
而冲进城的各路藩镇jūn_duì 们，也同样军纪败坏，抢掠、奸-yín 、烧杀这些传统保留节目，也不厌其烦地一再上演。想想，一个完好的皇宫有什么用？只供皇帝一人享乐罢了，于我们有何干？于是，为了独乐乐不如众乐乐，为了在抢夺皇宫的珍宝和美女之后毁灭罪证，攻进皇宫的各藩jūn_duì 也乐于见到大火漫延。没有一支打着大唐旗号的jūn_duì 来拯救大唐的皇宫，甚至说不定还有人帮忙多添几把火，让它烧得更有效率，美丽的皇家园林，完全被烈焰与浓烟掩盖。至于已经成为忠臣的李克用，就别指望他这种一心军功的好战分子居然还能想得起来要保护文物了。
黄巢起事以来，空前激烈的“百都大战”结束了，明眼的人都能清楚出：输家是大齐，但赢家，也决不是大唐。
齐军逃离了长安，大明宫还在燃烧，这座已经渡过了二百多年风霜雨雪的华丽宫城，这座规模比明清紫禁城大了足足四倍的巨大皇宫，这座曾见证过“万国衣冠拜冕旒”之盛世繁华的巍峨殿宇，就这样在熊熊的祝融之焰中，大部份化为了灰烬，给后世留下的，只是断壁残垣，和野草漫漫。
如日之升，则曰大明，当这个名字就象征着无限荣光的建筑群消逝于世间，大唐皇朝曾经的辉煌与荣耀，也如西落的夕阳，确凿无疑地，逝去了……
日落长安，暮色苍茫，前路漫漫，来日苦长，闻者惊心，言者心伤，煌煌大唐，殒逝远方，群魔共舞，貔貅嚣张，生灵涂炭，神州血染，何求彝鼎，祭我国殇！
此战之后，杨复光为收复长安所作的造捷露布中明确提到：“雁门节度使李克用神传将略，天付忠贞，机谋与武艺皆优，臣节共本心相称。杀贼无非手刃，入阵率以身先，可谓雄才，得名飞将。自统本军南下，与臣同力前驱，虽在寝餐，不忘寇孽……自收平京阙，二面皆立大功，若破敌摧凶，李克用实居其首。其余将佐，同效驱驰……”
出名的、得好处的很多，其中以李克用为最，但前任唐军总指挥王铎呢？几乎无人与闻。
李曜心里明白，敬翔拿此来说事，其中必有缘故。