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乾清宫，朱瞻基还沉浸在王贤离京的震惊中，朱棣又抛出一个重磅炸弹！
“基儿，把当值的内阁叫过来，朕要下诏。”朱棣的表情，比方才要凝重许多倍，语气也沉重太多。
“是。”朱瞻基未及多想，赶紧将当值的金幼孜唤来。这时，太监已经铺好了黄缎子，笔和墨都是现成的。金幼孜在御案后站定，拿起毛笔，调整下呼吸，便静静的等着皇帝口述。
朱棣的心情，比方才愈加沉重，在御案前来回踱步足足十几趟，才艰难的开口道：“朕躬膺天命，祗绍鸿图，爰仿古制，肇建两京，乃永乐十六年正月十五日奉天等三殿灾，朕心惶惧，莫知所措……”
“啊……”听了朱棣的话，一旁侍立的朱瞻基，忍不住低呼一声。金幼孜那握笔的手，也不禁微微颤抖，抬起头来，眼含热泪看着皇帝：“陛下……”
“不要说话，继续。”朱棣微微摇头，继续踱步一阵，情绪愈发激动起来：“意者於敬天事神之礼有所怠欤？！或法祖有戾而政务有乖欤？！或小人在位贤人隐遁而善恶不分欤？！”
皇帝越说越激动，声音也愈发高亢起来，除了执笔疾书的金幼孜，包括太孙在内，大殿所有人都跪在地上！皇帝那愤怒的声音，依然在宫殿中盘旋：
“或刑狱冤滥及无辜而曲直不辨欤？！或谗慝交作谄谀并进而忠言不入欤？！或横征暴敛剥削而殃及田里欤？！或赏罚不当资财妄费而国用无度欤？！”
皇帝的眼眶已经红了，声音也嘶哑起来，甚至要扶着御案才能站稳，仿佛所有的力气都被这一个个问句抽走了？
朱瞻基已经泪流满面，终于忍不住哽咽道：“皇爷爷，别说了，这只是人祸，不是天灾啊！”
朱棣却并不理会，依然用尽力气，一个字一个字往外挤道：“或租税太重徭役不均而民生不遂欤？！或军旅未息征调无方而粮饷空乏欤？！或工作过度徵需繁数而民力凋弊欤？！或奸人附势群吏弄法抑有司罢软贪残恣纵而致是欤？！”说完，皇帝一抹眼眶的泪水，仰天长叹道：“下厉于民，上违于天，朕之冥昧，未究所由……尔文武群臣受朕委任，休戚是同，朕所行果有不当，宜条陈无隐，庶图悛改，以回天意。钦此！”
最后几个字，用尽了皇帝最后的力气。说完，朱棣眼前一黑，似乎要晕倒，唬得朱瞻基等人赶忙爬起来，想要上前搀扶。却见皇帝摆了摆手，扶在御案上的另一只手青筋暴起，用尽力气撑住了自己的躯干！
皇帝直挺挺立在那里，沉声道：“下诏吧！”
“是……”金幼孜跪地俯身叩首，脸上已经满是泪水！
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皇帝下罪己诏的消息，如炸雷一般，把所有人都震惊的目瞪口呆！
“什么？！”王贤正在锦衣卫衙门，和众手下交代离京后的安排，得知此讯震惊莫名道：“罪己诏？！”他本以为前日里，皇上不过是故作姿态，想不到今日便下了罪己诏！可想而知，这对刚愎自用、自诩千古一帝的朱棣来说，是何等艰难的决定！可想而知，三大殿被焚，对皇帝是何等沉重的打击！
片刻之后，王贤得到了罪己诏的全文，草草浏览一遍，他明白了，这道诏书是不下也得下的。无论如何，不管有什么样的原因，象征至高皇权的三大殿被焚，都会被天下人视为天子失德、天命不佑的象征！这对整个帝国、对皇帝陛下来说，都是一次不容回避的执政危机！朱棣必须要正面解决、消解危机，才能让他的帝国继续正常运转下去，否则就像被卡住齿轮的机械，会使帝国陷入停滞，往日掩盖起来的危机，也会竞相浮现出来！
朱棣的处理是非常高明的。下罪己诏的前提，是已经证实天火之说纯属无稽之谈，是白莲教纵火而已。皇帝这时候认错态度越诚恳，越会被视为品格高尚、勇于揽责！乃至代臣民受过！若是没有查明纵火案，皇帝是万万不会下这罪己诏的，那样会坐实了‘天怒人怨’，皇帝失德！
现在案情查明，罪己诏已下，臣民对皇帝的非议便去了七七八八……但明眼人一眼就能看出，皇帝就三大殿失火的原因连发十余问，让臣子帮他找答案，却只字未提是迁都所致！可见，朱棣断不容许任何人非议迁都之事！
然而，偏有那不长眼之辈，刚刚被东厂放回来，见皇帝下诏罪己，还要求臣子随便批评自己！便以为皇帝是迫于压力，准备服软了！礼部主事萧仪竟当日就上书，直言三大殿遭受火灾，是因为迁都的缘故！