彭泽粮草物资充足，加上李琪也不是个庸材，苦心经营的他并不甘心失败，要知道他当初率大半京营大军反叛，部下不少忠于他的将官都在彭泽，自从魏忠贤袒护那个李朝钦，把出征湖广战败的责任大半推到他头上之后，他似乎也认清了魏忠贤的为人，两人起了闲隙，于是他就暗中投靠了太后许蓉蓉一系，这也使得许蓉蓉在朝中的实力大涨，增大了于魏忠贤对话的资本，他这个江西总督一半是许蓉蓉的作用，还有一半就是魏忠贤想借熊廷弼的手除去李琪这个“二物仔”，李琪自然十分清楚魏忠贤的用心，但呆在南京城内可能那一天就会无声无息的消失，而出了南京就天高任鸟飞，虽然危机依然存在，但闪转腾挪的空间多了，危险与机遇并存，而新主子也迫切需要一直强而有力的力量来支持她，在这之前太后许蓉蓉虽然地位尊崇，但处处受制于魏忠贤，甚至连见一次自己的儿子都得得到魏忠贤得许可才行，手下更是没有亲信执掌军权的大将，李琪正好乘虚而入，一举成为许蓉蓉最亲信的大将，才重新执掌兵权，还外方做了一省总督、封疆大吏。
李琪对权利富贵的渴望追逐不下于崔呈秀、许显纯之流，手握重兵之后开始培植自己的实力，将京营中原来忠于自己的将校一一调出，安排进入自己控制的江西各卫中，不断整合训练，终于让他拉出来一支七万人的善战之军，再就是审时度势，选择了彭泽这个兵家久战要冲做为自己的基地，修缮城防，精炼士卒，忠于让他挺起了腰杆，正准备大干一场的时候，朱影龙发动了南征，他治下的江西即将面临的湖广熊廷弼的打击，于是先一步，将江西境内嫡系主力暗中撤入彭泽，留下部分战力底下或者是不停自己指挥的jūn_duì ，在江西唱起了大面积的空城计，这使得挥军进入江西境内的熊廷弼闹了一个满头雾水，搞不清楚李琪的动作，李琪做的隐秘，暗影一时间也没有能察觉到他的图谋，直到熊廷弼发现了李琪所在的彭泽，这个时候李琪已经基本完成了兵力收缩，七万大军坚守的彭泽城如同铜墙铁壁，就是名将如熊廷弼也暂时拿他没有办法，就是困守，短时间要想拿下七万精兵坚守的城池显然是有些困难，而不管怎么引诱，李琪坚守不出，熊廷弼如同老鼠拉龟无从下手，本身jūn_duì 也不比李琪多多少，因此就在彭泽城耗上了。
尽管熊廷弼并没有表现出急切东进的迹象，但李琪也不是笨蛋，只要他守住这彭泽一地，就等于拖住了熊廷弼手中这十数万大军，使其不得与新军主力一同围攻南京，这个策略及其有效，而李琪也做到了这一点，并且还迫使南征主帅袁崇焕改变原来的进兵策略，从这一点上看，李琪虽不算惊世奇才那样的名将，但至少也是一个合格将领，能坐上京营提督这个位置上的将领即便有魏忠贤这样的权阉推荐，本身能力不够也是不行的，天启帝再怎么信任魏忠贤也总会考虑一下自己本身的安全。
而在调整南征策略之后，李琪坚守彭泽牵制熊廷弼十数万大军的策略没有了效果，熊廷弼也安定心来做攻陷彭泽的准备，把贺人龙调回，另派一员副将继续扫荡江西境内剩余的府县，火炮、云梯、攻城车、还有火箭等等攻城利器不断的运送到彭泽城下，这些将决定彭泽城内数十万军民的命运。
彭泽一战最大的收获就是实战检验了火炮集团攻击在攻城战上运动的巨大的威力，获得此战争利器的熊廷弼如同摧枯拉朽一般摧毁了李琪苦心孤诣搞出来城防系统，同时他也在心里埋怨朱影龙这个皇帝女婿，要是他早一点调集这么多火炮给他，彭泽早就被攻破了，何须等到战略调整之后再费力气，伤亡也少了许多，要知道他这一路打的最辛苦，敌我伤亡也是最大的，彭泽一战，最后清理伤亡，己方伤亡两万多一点，李琪部下七万人死伤过半，俘虏整编后，能战者仅有两万人，百姓伤亡就更难统计了，必须等江西平定之后才有确切的数字。
李琪战死，从其住处搜出数份没有烧毁的信件，署名居然是伪明太后许蓉蓉身边最信任的太监大总管韩赞周的名字，熊廷弼意识到这里面一定不同寻常的关系，连同报捷奏折一同用八百里快马送至扬州行宫。