会议虽然最后没有得出什么结果，但朱影龙还是指定了五部一科的负责人，暂时遵照他所写的内秘文件上的东西执行，等发现问题再讨论，毕竟朱影龙搞出来的这个东西是没有经过实践的，行不行的通做了才知道，这本来就是一个分上下，主仆的时代，主人的命令，从属是不得不遵从的，朱影龙那可笑的民主思想只能在心里想想罢了，人的思想不是一朝一夕能改变的，尤其是老百姓连自己名字都不会写的时代。
孙承宗去掉军事学院的院长职务，改任名誉院长和参谋部的部长，周顺昌、史可法为副，院长由朱影龙亲自担任；徐光启任教育部的部长，黄尊素为副，黄宗羲、张缚、张采、魏学廉等人辅助；安全部由熊廷弼执掌，同时兼任军事学院的副院长，熊兆琏和熊瑚兄妹共同辅助，商务部，王妃周滢宁亲掌，田家兄妹和沈家主导以及部分山东白莲教的产业，科技部，虽然有些反对的声音，认为女子不得掌权，但这毕竟不是朝廷，众人坚持也没有理由，王妃掌财也无可厚非；宋应星执掌科技部，兼任学院教授，瞿式耜和西洋教士艾儒略辅助；至于情报科当然是朱影龙的心腹爱将周淮安统领。再就是设立一个秘书处，由王承恩任处长，徐应元暂时充当第一秘书。
当处理完这些和宣布任命之后，已是是深夜子时了，朱影龙在听雨轩的书房还剩下他自己，徐应元，史可法以及孙承宗共四人，朱影龙命三人下去休息，自己却并没有动。
“王爷，是承宗糊涂，以为孙慎行他想通了，这才让他列席的，请王爷降罪！”孙承宗等徐应元和史可法离去，突然给朱影龙下跪道。
朱影龙吓了一跳，忙站起来相扶道：“孙老院长请起，不是说过不准再行这种跪拜大礼吗？老院长你怎么还这样？”
“王爷，今晚之事，的确是承宗思虑不周，差点酿成大祸，如果王爷不责罚承宗，承宗也没有脸面为王爷效力了！”孙承宗恳切的道。
朱影龙长叹一口气，今晚的事情已经够让他头疼的了，于是道：“行了，本王依你就是。”待孙承宗站立起来，朱影龙突然正色道：“但是有一条，以后见到本王绝对不能再行跪拜大礼了！”
“是，王爷。”孙承宗应道。
“本王也不知道该怎么处罚你，你一把年纪了，打是不能的，关禁闭吧，那么多事情，那是本王自找麻烦，还需要为本王多出力呢，不如这处罚就先欠着，等以后本王想到处罚你的办法再说？”朱影龙以商量的语气道。
“这怎么可以呢？”孙承宗不同意道。
“怎么不可以，临战之前，大将犯了军规，不也可以暂且不责打军棍，让其戴罪立功的嘛，古有先例，今有何不可？”朱影龙反问道。
“那样情况下的确可以戴罪立功，可承宗现在如何戴罪立功？”孙承宗有些不死心的问道。
杀一个孙慎行容易，但是这样会让现在刚归顺自己的人寒心，杀是不能杀的，朱影龙脑筋一转，看着孙承宗道：“孙老院长，这戴罪立功的机会就在眼前，你怎么想不到呢？”
“王爷莫非是想让承宗继续劝说那孙慎行归顺，他当众如此辱骂王爷，难道王爷还？”孙承宗似乎想到了什么，露出疑惑的神色问道。
“本王正有此意。”朱影龙点头道。
“不，不行，承宗与他相交十数年，他这个人是属犟驴的，牵着不走，打着还倒退，王爷，你能否重新给一个处罚？”孙承宗居然装出可怜的样子道。