之后，扉间与部下猿飞日斩、水户门炎、转寝小春、志村团藏、秋道取风、宇智波镜一同被大约有20人的金角部队追击，众人商量需要让其中一个人担当诱饵来引诱敌军，以保证其他队友能够有时间顺利逃脱。扉间为选择正确的继承人而暗中考验着部下。团藏虽然抱持着想要自告奋勇担当诱饵的心念，但在关键时刻却因胆怯而没有说出。此时日斩挺身而出，提出让自己担当诱饵。
最终扉间为了木叶隐村的未来而决定亲自担当诱饵，临行前对日斩的行为表示赞许，并授命日斩成为下一代的火影，之后便因掩护日斩等人而牺牲。
中忍考试 中忍考试篇，与柱间一同被复活 在木叶毁灭行动中，扉间与哥哥柱间一同被大蛇丸以秽土转生的形式复活，他们的意志被完全抹杀，被迫参加战斗，二人无法发挥原本的实力。 在战斗过程中，扉间使用水遁忍术与猿飞日斩展开激烈的战斗，由于两人是秽土身躯拥有不死身，所以只能用封印术，或用武力禁锢他们的动作，于是三代火影使用尸鬼封尽将两位火影的灵魂和大蛇丸的双手一同封印，自己也因此牺牲。
忍界大战 在第四次忍界大战中，大蛇丸获取漩涡一族收纳堂的死神面具，切开腹部释放了被死神吞掉的灵魂，恢复了双手，利用佐助体内的四个白绝分身作为活体祭品，以秽土转生的形式复活了历代火影，期间扉间发动怪力爆发出强大的空气流与蓝色的查克拉恐吓佐助、重吾、水月、大蛇丸，连墙壁都被击碎。之后扉间本想解除秽土转生的控制，但大蛇丸通过柱间细胞加强操控，使扉间无法摆脱。
期间为佐助讲述了宇智波的本质，虽然秽土之身的扉间未能完全展现全盛时期的实力，但仍能够隔空将墙壁击碎，其实力强大由此可见。
扉间奔赴战场后，与其他三位火影联合发动四赤阳阵封住十尾；而此时的十尾释放出一颗尾兽玉，企图破坏结界，二代火影扉间清楚这招的底细，所以并不担心结界被尾兽玉打破，而是冷静的说声我瞧瞧。之后十尾自食苦果了尾兽玉。
随后扉间自豪的笑了，因为与二代火影扉间生前对战的宇智波忍者相比，二代火影从没见过这样强力的加具土命，因此，二代火影分析出这是用比例几乎完全相同的查克拉混合而成的忍术，就算长年的搭档也很难做到。 漫画图片 此时带土已被斑的查克拉操控，初代火影与二代火影因需维持结界来不及赶到带土那边，于是兄弟二人打算靠分身前去阻止斑操控带土使用轮回转世术，然而在维持四赤阳阵的情况下分身的数量会严重减少，因此使扉间只分出了两个影分身，二代火影意识到自己的力量竟会被被削弱到这种程度，但为了阻止斑就算数量少也只能上了，随后扉间的两个影分身奔向斑来到来到斑的面前。
而此时，四代使用三叉式苦无砍伤带土，斑的轮回天生发动也因此失败，二代火影分析出四代这是事先就在带土身上做了标记。 漫画图片 此时带土使用六道十尾柩印将十尾吸收在自己的体内，形成球体状，紧接着球体破碎。带土成功变成十尾人柱力，打破了柱间的明神门，利用背后红色的火焰形成的手扯碎了四赤阳阵，由于之间扉间集中在本体的力量太多了，所以站在斑面前的两个影分身也因此而消失。
为了分析带土的出招和能力，扉间与初代火影的木分身联手对抗十尾人柱力模式的宇智波带土，兄弟二人同时被带土使用求道玉的流体形态击碎半身，但扉间在被击碎的瞬间，不仅将多张起爆符贴在带土的身上，而且还在带土的身上做了飞雷神咒印纹样的标记，扉间的出手速度之快由此可见。随后柱间的木分身伸出两条树藤捆绑住带土，以便于扉间使用互乘起爆符轰炸带土。
紧接着，扉间无限连续通灵出起爆符并且集中于一点无限连续轰炸带土。由于此术攻击范围大，持续时间长，不仅炸飞了众多的十尾分裂体，连扉间的秽土身躯与柱间的木分身也因此被炸毁。 然而此招却被带土使用求道玉的流体形态防御了攻击，随后扉间的秽土身躯自行恢复。
漫画图片 在千钧一发之际，扉间利用影分身使用飞雷神之术转移十尾人柱力宇智波带土的求道玉，随后连同求道玉以及带土一起转移到了远处。营救了困境中的四代火影、漩涡鸣人、宇智波佐助，避免了不必要的损失。
之后扉间与四代火影使用飞雷神互瞬回旋术配合灼遁·光轮疾风漆黑矢零式击中带土，但被带土使用阴阳遁将其无效化。
此时，二代火影凭借自己生前的战斗经验冷静的分析出带土的能力是以阴阳遁为基础的术，能够将所有忍术无效，也就是说即使是秽土转生的身体，只要中招，也会因为无法转生而死亡，因此劝诫水门在之后的战斗中一定要更加谨慎。
接着扉间察觉到了带土不能化解仙术的弱点，以飞雷神之术配合鸣人的仙术螺旋丸瞬间移动至带土的身后对其造成伤害，并且从鸣人身上感受到了曾经与柱间并肩作战的感觉。
紧接着带土在地面上制造出神树并同时释放出四颗尾兽玉，第二代火影原本打算与水门使用飞雷神术一人转走一个，但因考虑到即使转走了两个，但剩余两个尾兽玉却无法转移的问题而尝试别的办法，初代火影告诉大家不用担心，只要改变尾兽玉的运行轨道就可以，到时候四位火影会想办法把它们打到海上，并拜托大家制造土遁之壁，自己用树界降诞将尾兽玉引导向大海，然而柱间的想法立即被带土彻底打消，带土使用六赤阳阵封将忍者联军封锁在结界里，之后二代火影意识到只能用飞雷神术把尾兽玉转移到结界外部去了，随后二代火影询问水门能否同时转移两个，然而四代火影的飞雷神在无法标记的情况下，一个已经是极限，所以水门尝试别的办法。
随后水门打算将尾兽玉连同树一起转移到结界外部去，然而这一想法却被带土嘲笑，在紧要关头，鸣人提出了一个主意，水门与鸣人碰拳使自己的查克拉与鸣人的查克拉进行接触，从而使自己的查克拉与鸣人留在忍者联军神树的查克拉连接了起来，因为忍者联军身上附有鸣人和九喇嘛的查克拉，所以使水门成功将忍者联军所有人转移到了结界外部，随后第二代火影也详细解说了这是利用了影分身的原理，即便自身的查克拉分散四处，只要有哪怕微量的查克拉残余，当本体为控制查克拉再次开始凝练时，分散的查克拉便会产生共鸣而联动。
紧接着扉间使用飞雷神之术将两大九尾完全体化的波风水门与漩涡鸣人转移至带土的身后，使用螺旋丸成功击中带土，但被带土使用阴阳遁抵挡。因此与带土打了平手。
此时的带土已经发动无限月读，神树的根茎疯狂地生长乱窜，所到之处忍者联军的查克拉都被吸走，为了营救被神树分裂体树藤缠绕住的鸣人，扉间使用水遁水断波接连切断了神树的树根。 漫画图片 之后，扉间以飞雷神术瞬间将鸣人、水门、日斩转移至忍者联军的战场。
期间从鸣人的身上看到了哥哥柱间的影子，深感鸣人在未来会成为超越哥哥柱间的火影。 漫画图片 之后扉间以飞雷神之术让陷入困境中的忍者联军脱困，并鼓舞大家不用怕尽管冲。
为给我爱罗留出时间救走鸣人，千手扉间瞅准斑自以为得手的瞬间，使用飞雷神斩从斑的背后展开偷袭。经过一番激战，当扉间使用飞雷神二段瞬间移动至斑的上空开始反攻时。斑使用轮墓将千手扉间定在半空中无法动弹，并利用黑棒封锁住扉间提炼查克拉的穴道。
他斑清楚扉间这招的可怕之处，毕竟弟弟泉奈就是被这招打败的，所以斑不会让扉间使用出来。斑也告知秽土身躯的的扉间发挥不出曾经的力量是有原因的。
随后扉间感知到佐助即将到来，为给佐助留出突袭的最佳时机，于是扉间使用水遁·天泣突袭斑，然而却被斑使用须佐能乎初始形态的手臂防御了攻击。由于此时的扉间已被斑利用黑棒封锁住提炼查克拉的穴道。因此使扉间无法拯救佐助，只能眼看着佐助被斑一刀刺穿身体。
为了挽救佐助的性命，扉间使用灵魂禁锢术将佐助的灵魂禁锢住一段时间，以此延缓佐助的死亡，其后指导帮助药师兜成功救治了宇智波佐助，随后扉间被开启六勾玉轮回眼并免疫黑棒受到的影响的佐助拔出黑棒，使扉间恢复了自由行动的能力，之后扉间以飞雷神之术将佐助送往战场，随后扉间的秽土身躯自行恢复。