本来朱载坖上疏嘉靖，想保祝续一条老命的，但是嘉靖没有答应朱载坖的请求，原因主要有两点，一来是嘉靖也要敲打一下朱载坖，不能翘了尾巴，忘乎所以。
第二就是嘉靖认为祝续人老成精，朱载坖未必能够把他彻底掌握，既然不能彻底掌握，那就不如干脆杀了，同时震慑一下祝家，免得他们再生些别样心思。
同时嘉靖也没有将祝家人的充军给免了，而是把这个做人情的机会给了朱载坖，因为按照大明律令，充军是可以赎刑的。
所谓赎刑，就是花钱减免刑罚的意思。赎法有二，有律得收赎者，有例的纳赎者。律赎无敢损益， 而纳赎之例，则因时权益。大明现在除了真犯死罪外的杂犯死罪、流、徒、杖、笞皆可赎，赎刑的方式也多种多样。
按照宣宗时的规定，杂犯死罪纳米一百石，流罪减二十石，徒五等三年者七十石，二年半至一年递减十石，但是现在大明赎刑的标准肯定是远远超过宣宗时了。
不过不管多少，其实对于祝家来说，都是没有任何意义了，因为祝家的所有财产，都在抄没之列，也就是说，只有朱载坖或者其他官员，才能为祝家赎刑。
况且祝家所犯的可是大案，赎刑的流程也极为严格。按照规定，对于流刑及死刑案件，应当由按察司应上报至刑部，刑部审查后须呈大理寺复审，死刑必须由皇帝批准，皇帝或大理寺准拟并作出赎刑决定，将判决逐层下达至该管按察司，按察司将罪囚解送初审机关执行。
南直隶没有按察司，一应事务直接由南京刑部管理，也就是说他们赎刑要先经南京刑部，然后再由刑部和大理寺审核后，报送嘉靖批准。
嘉靖将赎刑的审核放权给了朱载坖，就是想让他借此机会好控制祝家，同时利用赎刑，吊一下吴、徐两家的胃口，这些大家族一贯狡兔三窟，说不定在哪里还有没有被官府抄没的财产，正好可以借机抄没。
嘉靖拟定了相关的事情，一是将此案的经过昭告天下，以为后来者戒，二就是准备处理相关的涉事官员。
一就是和本案直接有关的官员，浙直总督赵文华、南直隶巡抚唐顺之，不能查知奸情，各罚俸半年，苏州知府林懋举，身为州县官员，放任周如斗与苏州士绅勾结，事情不能有所察觉，事后没有及时上报，降为知州，发边远任用。
二就是和周如斗有关的官员，右都御史鄢懋卿，不能整肃宪纲，罚俸半年，以为惩戒。南京都察院一应官员，俱为失察，降官一级，以观后效。吏部尚书李默，用人不当，罚俸半年，夺子孙荫官一级。
苏州推官海瑞，能够查知奸情，审明是非，升为苏州同知，署理府事。锦衣卫指挥掌南京锦衣卫事朱希孝、锦衣千户陆绎，忠勤王事，各加一级，南直隶巡按赵贞吉，审断得力，免考一次，赏银五十两。
嘉靖将一系列的决定公布后，朝堂上的官员们并没有想象中的议论汹汹，反而是一番常态的沉默，因为徐阶已经在下面做了大量的工作，安抚东南的官员，再加上此案已经是铁案了，任何人也翻不得。