虽然朝廷已经紧急下达命令，但是急递并没有带来什么好消息，倭寇在芜湖虽然受挫，但是并没有遏制倭寇向南京袭扰的步伐，南直隶急报：南陵倭流劫至芜湖，纵火烧南岸，突渡北岸，入市，各商民、义勇登屋，以瓦石、灰礶击之，贼多伤者，遂奔去。各商、兵下屋，生缚二倭，斩首十级。
接到芜湖传来的消息，大明君臣不禁有些哭笑不得，朝廷的官军、民壮遇贼即溃，反倒是百姓们组织起来，将这伙倭寇赶出了芜湖。强悍的倭寇登岸北岸时，无城垣可守的芜湖，商民、义勇登上屋顶，用最简单的瓦石、灰礶向敌人投掷。这样最原始的武器，却将倭贼打得昏头转向。
自浙江登岸以来，他们从未见过如此彪悍的百姓，不计生死，奋不顾身。被砸伤多名的倭寇，觉得此地危险，竟然下船奔走。
越战越勇的芜湖百姓，看到敌人逃遁，商民、兵壮迅速追赶，生擒两人，打死十人。仅剩五十余人的倭寇，逃之夭夭。
倭寇自芜湖退走之后，尚余53人，他们继续北上，更加猖狂，给整个大明带来了巨大震撼。
这伙倭寇灰溜溜北上，继续沿着长江，抵达太平府。
此时，操江巡抚史褒善正在太平府城中，得知倭寇进犯后，他紧急派遣一名千户，率领数量众多的乡兵、义勇、杀虎手，出城剿敌,在马厂与倭寇作战。
又一次，毫无意外的“大败”。
在芜湖，倭寇被普通百姓打得落花流水；在太平府，与正规军作战，他们却虎虎生威。嘉靖和朝廷闻报，已经不能用震惊来形容了，嘉靖竟然没有召见一名大臣商量此事，而是冷眼旁观。
紧接着就是漕运都御史郑晓的急报来了，郑晓的奏疏是弹劾史褒善的，堂堂留都门户，偌大的太平府城，惊慌失措的府城内官员，竟然采取了最消极的办法，太平府城城高堑深，守城兵壮无心剿敌，却砍断护城河的河桥，让倭寇无法入城。以此来“御敌”。
史褒善一代名臣，位列封疆大吏，大敌当前，竟然能出此“良策”，智谋尚不及芜湖百姓，郑晓一面与漕运总兵临淮侯李庭竹提兵赶赴南京设防。
倭寇看到太平府城如此英勇，并未久留，继续北上，直接冲击留都城外的江宁镇。江宁镇乃是南京城外的最后一道防线了，南京兵部尚书参赞机务张经并非不知兵的人，他知道江宁镇的重要性，亲自指挥朱襄统率官军镇守。
当然，张经如果知道朱襄是个什么货色的话，肯定能在南京兵部大堂就掐死他。
倭寇突入江宁镇时，这位指挥使朱襄竟然在饮酒作乐，不亦乐乎。倭寇杀入江宁镇，朱襄正袒裼纵酒。接到战报后，他仓猝率兵迎战，结果全军覆灭。官军与五十几名倭寇作战，官兵死者多达三百多人。他所率的官军崩溃，江宁镇惨败，最直接的后果：留都南京门户洞开，倭寇直驱留都城下。
这下大明朝的底裤连带着嘉靖的底裤都没有了，唐顺之、戚继光等都提兵赶赴南京，最先赶到的是总督漕运都御史郑晓和漕运总兵李庭竹，结果这二位连南京城都没进去。
南京戒严，十三城门尽锁。