朱载坖显然不是这么看的，倭寇与海盗，虽然说起来在大明是一路货色的。但是他们在具体的目的上还是有很大的不同。倭寇并非大明就有了，前元时就已经有倭寇的记载了。
自大明建国后，倭寇袭扰的记载就不绝于史册，因为日本进入南北朝分裂时期，在长期战乱中失败的南朝封建主组织武士劫掠中国与朝鲜沿海地区，就成为了倭寇的来源。只是在大明强盛的时候，倭寇不敢劫掠大明，就去欺负朝鲜而已，就是永乐时，倭寇也时常袭击大明。
只不过朱老四不惯着他们罢了，遣名将刘江，率明军于辽东望海埚全歼来侵之倭，此后海防较为平静。倭寇的目的，就是劫掠，若是大明强大，他也能和大明做生意，只不过他们更擅长的是无本的生意罢了。
而海盗则不同了。他们本就在海商和海盗之间灵活切换，但是由于大明的海禁政策，他们无法进行正常的贸易，那就只能做无本的买卖了，现在浙直沿海地区形成了一批势力强大的海寇头目，其不仅拥有庞大队伍，在浙直沿海地区建立据点，造成大规模持续性破坏，而且与外国势力相勾结，不再是单纯的国内反叛势力。
以眼下海盗中的巨寇名贼，汪直（王直）为例，汪直与叶宗满等人前往广东造船，将带硝黄丝绵等违禁物，抵日本、暹罗、 西洋等国，往来互市者五六年，致富不赀，五六年时间里赚取大量财富。因其在走私买卖中颇讲信义，便得到了番商信任。
在嘉靖二十三年前后，汪直开始与倭寇势力产生联系，为其后进入日本建立巢穴、吸引倭寇加入队伍奠定基础。在许栋麾下时，汪直收毛烈、汪汝贤（或 王汝贤）、汪滶（或王滶）等人为义子心腹，实力逐渐壮大。
现在的浙直沿海洋面上，汪直成为实力最强的海寇。党徒千人、舰船数百，与徐海、陈东、 叶明等海寇首领结盟，招引倭寇，建立海上秩序和商贸规则。
虽然汪直现在势力已经极大了，但是但其始终希望能有机会与官府谈判放开贸易，将走私贸易合法化。所以对于倭寇和海盗，要区别对待。当然，眼下只有进剿，别无他图。
朱载坖于是讲了自己的看法，眼下官军接连大胜，倭寇之前在大明沿海建立据点，集中大批倭寇袭扰大明的做法已经行不通了，接下来倭寇一定会分散兵力，前来到处袭扰大明。
而海盗们，为了达成使得大明开放海贸的目的，也必然会有所动作。说白了，嘉靖之前的海寇，虽然也有进行商贸者，但是大多以私盐贩角色存在。而前来中国入犯的倭寇，也只是进行劫掠勾当。与前代相比，嘉靖年间海寇在身份性质方面，“商、盗” 双重性更加明显。此时海寇已不再局限于从事私盐贩卖等小型贸易，而是开展跨国走私商贸，贸易规模更加庞大。
所以汪直等人是以袭扰为筹码，希望换取朝廷开放海贸的，而眼下汪直之前的办法已经行不通了，他必然变更办法，作为一个商人，汪直深谙谈判之道，他知道，要想和大明朝廷谈判，必须展现出强大的实力才行，之前在沿海占据据点的方式现在已经行不通了。
朱载坖判断，汪直一定会改变方式，而行险袭扰南京，就是汪直的选择之一。因为袭扰大明的留都，属于杀害不大，侮辱性极强的行为，更像是政治行为，而非单纯的劫掠。