待臣子们走后，嘉靖拿出朱载坖当时的奏疏来，仔细看了一下，叫来黄锦说道：“你去趟裕王府，将这两份塘报和今日臣子所议，告知裕王，看看他有什么说的。”
黄锦领命赶往裕王府，此时的裕王府，朱载坖正在和李妃讲昨日在宫里的事情，昨天的雷峰塔让不少妃嫔都为之落泪，李妃也很好奇裕王从哪得知这个故事的，正缠着裕王讲白蛇传呢。
黄锦来了，朱载坖立刻前去迎接他，黄锦与朱载坖见面行礼后，黄锦便问道：“殿下可否书房一叙？”朱载坖会意，将黄锦请进书房，屏退左右，黄锦将两封塘报拿出来，并将今日臣僚们所商议的过程都告知朱载坖了，黄锦说道：“陛下的意思，殿下对倭寇比较了解，殿下有何看法。”
朱载坖想了想，半晌才开口说道：“孤以为，首先要做的就是明确一点，倭寇猖獗至今，不是一时半会儿能够剿灭的。譬如疾病显现，虽是疥藓之症，然盖因人体正气不足所致，故欲疗此疾，宜先扶正气，非是汤药一剂就立竿见影的。现在陛下已经分遣名臣良将分守东南，然练兵教战，岂是数日可见之事？”
朱载坖继续说道：“现在官军羸弱，诸将练兵教战，需要时日，而倭寇猖獗，现在我军只能取守势，偶有失利，可以理解，不应撤换将帅，而致前功尽弃也！待士卒训练得力，军器完备，以堂堂之阵，剿灭倭寇，正其时也！”
关于喻显科等处理，朱载坖显然与臣子们的看法不一样，朱载坖认为，不管上海县的失守有什么原因，喻显科临阵脱逃，放弃领土，那是随便怎么也不能饶恕的。按照大明律，失律丧师失地，事关重典，大辟都是轻的。
成祖朝的靖难名将丘福，远征大漠，中计兵败，丘福与王忠、火真尽皆被俘遇害，麾下全军覆没。按说丘福虽然昏聩，但是还算是保全名节，未曾降敌，但是朱棣依然剥夺丘福的世袭爵位，将其全家流放海南。
王世贞曾经评价此事：丘福虽辱国，犹不失死节，遂至籍没流放，亦殊罚也。认为对于丘福的处罚有些过于严厉了，毕竟丘福没有背叛大明，也算的以死报国了，而且丘福是靖难名将，生性朴实戆厚，但作战勇猛。他在靖难功臣之中，出谋划策虽然不及张玉，敢战敢冲却可与朱能相比。燕军每有战胜，诸将都争相言功，唯独丘福落于人后。成祖常叹道：“丘将军功，我自知之。”
这样的成祖心腹爱将，丧师失律，一样遭到成祖严惩，这才是治军之道。
朱载坖说道：“喻显科无丘福之功，而罪远过之。丘福虽年老昏聩，然犹力战被执，死节殉国。喻显科辈，比丘福不吝天壤之别？若将此辈轻轻放过，何以为天下牧守者诫？臣请显戮此贼，传首南直隶、浙江、福建、两广各州县，为后来者诫，其三族皆充军辽东。”