城内的绿营清军和民壮最终完全溃败，就连晋商护卫队组成的督战队都镇不住。督战队砍翻了一批逃下来的清兵和民壮，更多的人溃败下来，把督战队都冲散了。
逃回来的晋商护卫队连滚带爬的跑进了巡抚衙门，跪在张凤仪面前苦苦相劝：“大人！快跑吧！让卑职保护您从北门杀出去！”
张凤仪苦笑一声：“老夫已经决定殉国了！要走你们走吧！”
“大人您不走，我们也不走了！”一名护卫队员道，“卑职的家主都已经被伪明王逆列入必杀名单，我们能跑到哪里去？济南失守，京城也快保不住了！”
“对！”另外一名晋商护卫队员也说道，“我们都不走了！没有地方走！我们愿和大人共生死！”
济南城内，喊杀声震天，绿营清兵和民壮们纷纷投降。
投降之后的民壮，立即转过头来，带着明军直扑巡抚衙门。事实上，在攻城战中，死在由晋商护卫队组成的督战队刀下的民壮，比死在明军枪炮之下还多！因为很多民壮都是当地人，有些都是兄弟、堂兄弟、表兄弟、叔侄、小舅子、姐夫妹夫之类的自家亲人在同一支军中服役，本来他们就不想和强大的琼州军为敌，都是被张凤仪逼迫的，很多人因为顶不住退却，结果被督战队砍了脑袋。这些民壮们亲眼看到自己的亲人惨死在督战队的刀下，所以他们恨透了张凤仪。
张凤仪带着最后的八百晋商护卫队，先一把火烧毁了仓库，之后就在巡抚衙门内布置防御，做最后的抵抗。
济南城内的山东巡抚衙门，原本是德王府，崇祯十二年，济南被清军攻破，德王府被清军一把火烧毁。清军入关之后，山东巡抚周有德修复了德王府，并把这里改成巡抚衙门。德王府规模宏大，周围有两丈高的宫墙，内有三座大殿，还有众多的建筑群。不过张凤仪来山东上任的时候，并未带家眷来济南，偌大的巡抚衙门，就变成他和晋商护卫队居住的一座内城。张凤仪带着残存的护卫队，凭借德王府负隅顽抗。
“杀了张凤仪！为我们的亲人报仇！”民壮们大声呐喊着，向被改成巡抚衙门的原德王府发起攻击。
“轰隆”巡抚衙门的大门被人用大圆木撞开，成群结队的民壮涌入巡抚衙门内。
几十名武功高强的护卫队在门内的大院中拦住民壮，这些晋商护卫队员确实是很能打，民壮也并非是正规军，也是乌合之众，不懂得结阵进攻，完全依靠蛮力。结果在大院内，双方展开激烈的厮杀，几十名护卫队员砍翻了两百多名民壮。
正当护卫队砍杀民壮的时候，外面冲入了两百名明军火枪手，而且更加要命的是，这些火枪手都是后装线膛枪手！
“列队，放！”两百火枪手分成三排，第一排趴下，第二批半蹲，第三排站立。
“砰砰砰”白色的硝烟腾起，几十名正在逞凶的晋商护卫队员全部被打成了马蜂窝。
两百火枪手冲过前庭，往中庭冲去。在奔跑的过程中，火枪手压下枪托，露出后面的枪膛。枪手们抠出枪膛内的铜底板，又从腰间取出纸质弹壳铜底火子弹，把子弹塞进去，再一压枪托，便完成了装填。
就在明军火枪手冲入中庭的时候，前面涌出了两百多武功高强的护卫队员。