本来西班牙人和葡萄牙人对这样的战利品分成还颇有些不满意，但张玉坤答应让西班牙和葡萄牙在巴达维亚投资建设港口，并根据王新宇事先给他的提议，对西班牙和葡萄牙等国开放开放巴达维亚和新加坡等港口，以优惠价格给他们提供货物。
从长远角度来看，西班牙和葡萄牙获得了明国给予的“贸易最惠国”待遇，有了这个待遇之后，他们能够赚到更多钱。
另外，西班牙和葡萄牙无论是出兵人数还是出动的舰船都不多，能够分到价值六百万两白银的战利品，他们其实也很满意了。这次出来收拾荷兰人，这两个国家基本上没有受到什么损失，还获得了巴达维亚港口的停靠权。
李定国拿到了一千五百万两银子，也很满足了，那么多银子，远超过他之前的想象。尽管他知道张玉坤还偷偷收了一批银子，但他也当成不知道一样没有吱声，拿到战利品之后，李定国就带上三千人马撤回缅甸，留下两千人协助南洋海军驻守巴达维亚。
“晋王离开这里了，接下来我们要做的事情就是加固炮台，增加新的火炮。”张玉坤开始安排加固巴达维亚炮台的工程。
巴达维亚被明军攻占了之后，按照中国人的习惯改名成椰城。至此，南洋海军在东南亚有了三座港口：延平港、狮城港和椰城港。
延平港和狮城港的建设比较早，防御坚固。延平港是以河港出海的港口，在入海口布置水雷，丛林里面布置隐蔽的炮台，荷兰人就无法攻下这座港口，更何况延平港位置隐蔽，荷兰人还不知道这里。至于狮城港，位置十分重要，扼守住马六甲海峡要冲，南洋海军在这里建造了最坚固的炮台，布置了最新锐的重炮。所以说，不管是延平港还是狮城港，荷兰人都不可能拿得下来。
至于明廷所在的兴都港，荷兰人也没那么容易进去。首先那是大金沙江入海的港口，下游三角洲河道复杂，荷兰人无法探明航道水深情况，大型战船不敢贸然进入江口内。而小船进来，兴都的炮台可不是吃素的。
张玉坤比较不放心的就是椰城炮台，原来荷兰人修建的四座炮台，上面虽然设有六十四磅重加农炮和三十二磅重加农炮等重炮，可是这些重炮的数量不多，远距离射击，这些重炮的精度也不高。若是荷兰舰队要强行突破进入港内，仅仅依靠这四座炮台，根本无法挡住拥有大量战列舰的荷兰舰队。
要堵住荷兰人进入椰城港区内，就要对炮台和港湾口重新进行布置。
椰城港湾的入口处比较开阔，并不是很有利于防守，四座炮台难以完全封死港口。因此张玉坤首先要做的是，对港区的航道进行布置。
一些本来就比较浅，但是大船可以进出的航道，派人打下水下暗桩。主航道上，布置了大量水雷。
最早的时候，万历年间使用的水雷是木壳雷，郑成功后来又造出了陶瓷雷。现在王新宇使用的是经过改进的陶瓷水雷。
陶瓷外壳水雷也是一种使用钢轮燧发引信的水雷，这种水雷使用石蜡密封防水，水雷外壳上面开了五个孔，铜管插入孔内。在铜管里面安装有铁制的触角，伸出水雷外面。这种触角其实就是一种用来撞击的引信。当敌舰撞上触角，触角就会被压缩，引发水雷里面的钢轮转动，燧石点火，点燃引药，导致火药爆炸。
这种专门用来对付大型舰船的水雷每一枚都有两百多斤重，看起来就好像小口的大水缸一样，内部装填了一百多斤黑[火]药，只要一枚水雷爆炸，就能在船底炸开一个直径五米的大洞，这样的爆炸威力，足以炸沉七省级战列舰。
水雷底部有铁环，上面挂上铁链，固定在海底，可以避免水雷被海水冲走。
飞剪快帆船从东番枪炮厂运来了一百多枚新式水雷，水雷运到之后，明军水手们就驾驶着布雷的小船，在椰城港湾外围布置水雷。
椰城港口主航道水深比较深，涨潮时可以达到十五米深。如果只是简单的把水雷丢下去，放下锚链，那么锚链可能在水底扎得不稳，而导致水雷被水流带走。为了保证布雷的可靠性，明军在退潮的时候布雷。布雷的水兵都是水性最好的水兵，他们身上捆着绳索，从小船上滑下来，沿着一根粗木潜入水底。
小船上的人把水雷推入水中，因为水雷底部的锚链重量大，原本可以漂浮在海面的水缸被锚链带入水中。
潜入水底的明军水兵嘴里含着一根用来通气的竹管，潜入水底打下木桩。然后把水雷锚链固定在海底的同时，又拉出一条铁链，把锚链拴在木桩上。
布置水雷的同时，在一些水比较浅的次要航道上，明军水手潜入水底，打下水底暗桩。
尽管水雷和水底暗桩无法完全阻拦荷兰舰队进入椰城港内，但是在航道上布置了水雷和水下暗桩之后，再加上岸上炮台的封锁，就能完全阻拦住荷兰人的舰队。因为荷兰人若是要排除水雷，或者是派人去摧毁水下暗桩，他们的舰队就不得不停在雷区前面，那样就落入了炮台火力覆盖范围内。
如果荷兰人大舰不进来，而是用小船来排除水雷的话，那么刚刚布置在炮台上的新式小炮就能精确的击毁小船。
新式小炮，是在王新宇的要求下生产的四门三磅前装六角线膛炮，这四门炮不久前刚刚才完工，从东番枪炮厂生产出来。它们原本是配备给陆军的，打算用来攻打广州之类的坚城的时候，专门用来压制清军炮台所用。但张玉坤却把这四门炮暂时借了过来，安置在炮台上面，专门用来对付荷兰人的小船。
三磅线膛炮发射的实心炮弹威力比三磅滑膛炮要大了很多，而且射程远，精度非常高，打荷兰人用来排除障碍的小船，完全可以一炮击沉一艘船。
小型三磅前装六角线膛炮只不过是临时安放在炮台上的，不需要另外固定。这些小炮运到椰城炮台之后，在码头上卸下，直接就拉到炮台上，没有拆掉炮轮子就架起来，和陆军炮一样只要把后面的炮锄固定好，以两轮来支撑，只要瞄准了就能打。用完之后，再装船送去福建给王新宇的陆军使用。
当然这种小炮无法击沉荷兰人的大型战舰，像新加坡炮台的那种大型六角炮或者是明军快速战舰上的那种大型六角炮，价格又过于昂贵，不可能多造。为了加强炮台火力，张玉坤向葡萄牙人和西班牙人购买了十八门六十四磅炮台炮。
葡萄牙人和西班牙人把一万两千多磅重的巨炮装上船，送往椰城。这些炮本来就是马尼拉炮台的炮和澳门炮台的炮，葡萄牙人和西班牙人不需要另外造炮，他们把现成的炮上报，宣布报废，然后卖给王新宇。
有了这十八门六十四磅加农炮，加上炮台上面本来的十六门六十四磅加农炮，再加上三十二磅炮和不计其数的小炮，荷兰舰队若是进入椰城港湾，必然会被威力强大的炮台炮打得焦头烂额。
荷兰人所有的战列舰加起来火力肯定要超过炮台，但是炮台炮射程远，而且炮台不会被打沉，战列舰只要挨上多发六十四磅加农炮的炮弹，就会被击沉。