为了达到全歼的目的，舰载机们舍弃了庞大的日向号战列舰，转而先解决那些驱逐舰和巡洋舰。利用有限的弹药，舰载机飞行员们几乎是贴到近前才发动攻击，因此准确性极高，几乎所有的鱼雷和炸弹都找到了自己的目标。
巡洋舰和驱逐舰被一扫而空，等到飞机弹尽离开，海面上只剩下了孤零零的日向号战列舰。这样艰难的情况，已经没有了挽回的可能，山本五十六不禁仰天长叹，真是时不我待啊。
日向号最后的结局并未等待多久，残破的舰身缓慢前行了半个小时之后，碰上了迎面而来的潜艇大队。这支潜艇部队隶属于光海城总基地，在发现倭军联合舰队之后，各支舰队都抽调力量进行围剿，光海城为了保住城市，不被对方所攻击，潜艇部队也出击了。
这支有潜艇部队司令官陈涛少将亲自率领的，拥有十二艘海狼3型潜艇的庞大编队，也受到了侦察机报告。利用先进的电子导航仪，潜艇部队得以精确的找到了对方的位置，当他们接近夷州海峡入口的时候，已经隐隐看到了行驶而来的巨大黑影。虽然已是日近黄昏，陈涛还是从哪巨大的身形与倭国特有的塔式桅杆上，辨认出了对方的身份。
见到对方只是孤零零的一艘军舰，陈涛立刻兴奋了起来。他命令周围的十二艘潜艇靠拢过来，围剿这艘庞大的战列舰。排水量高达三万多吨的日向号战列舰，本应该拥有近24节的速度，但是因为动力装置受损，它只能以十二节的速度航行。
这样的速度给了潜艇充足的攻击机会，因为他们浮出水面的时候，速度能够达到17节。向前航行的倭国水兵们颇有劫后余生的感觉，他们并不知道海面之下还有着巨大威胁。
陈涛下达了进攻的命令，他所亲自指挥的3001号潜艇首先发射出两枚鱼雷。威力巨大的鱼雷以笔直的航迹，朝着日向号撞去，而已经从紧张战斗中松懈下来的倭国水兵们，还没有发现危险已经迫近。
轰的一声巨响，让倭国水兵们几乎立脚不稳，在战舰的左舷暴起大团的水雾，随后就是猛烈的火焰从舱门出蹿了出来。
“有敌袭。”倭兵们凄厉的惨叫声此起彼伏，他们喊叫着冲向自己的战位，但为时已晚。爆炸声就是最好的开火命令，随着一艘艘潜艇开始释放鱼雷，道道航迹向着日向号延伸。
这艘庞大的战列舰尚未作出什么规避动作，十四枚鱼雷就击中了他的舰身。剧烈大爆炸声让战列舰多处解体，随处可见的大洞让损管人员无所适从。无奈之下，山本五十六少将只好命令弃舰，倭国联合舰队硕果仅存的一艘战舰也被放弃了。